五大连池的湖泊水温5月中旬上升至10℃以上，9月下旬降至10℃以下、最高水温在7月(20～26℃)。五大连池共计有鱼类10科、39种，常见的种类有卿鱼、鲤鱼、“餐”鱼、鲢鱼、鳙、草鱼等。各池种类分布无差异、但群体数量有明显不同。三池因投放鲢、鳙鱼，目前以鲢鱼数量最多、其次是鲫鱼、青梢红鲌、鲤鱼等，五池以鲤鱼数量最多，一池、二池、四池均以鲫鱼数量最多。鱼类共10科39种，常见的种类有鲫鱼、鲤鱼、鳖条、鲢鱼、鳙鱼、草鱼等。90年代五大连池共鉴定出浮游藻类74 属，177种。

　　保护范围

　　五大连池自然保护区八个天然形成的池子：一池子、二池子、三池子、四池子、五池子、南月牙泡、北月牙泡、药泉湖。地理坐标为东经126°00′～126°26′、北纬48°34′～48°48′。